Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8N3

Vwc2, Brorin, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vwc2Q8C8N3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Vwc2Q8C8N3 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms