Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ubash3bQ8BGG7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms