Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TwistnbQ78WZ7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms