Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDE8

Mfsd13a, Transmembrane protein 180, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd13aQ6PDE8 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Mfsd13aQ6PDE8 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Mfsd13aQ6PDE8 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.4 ms