Protein–RNA interactions for Protein: Q66X05

Nlrp4f, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4F, mousemouse

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4fQ66X05 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrp4fQ66X05 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms