Protein–RNA interactions for Protein: Q60931

Vdac3, Voltage-dependent anion-selective channel protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac3Q60931 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Vdac3Q60931 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Vdac3Q60931 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms