Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 199 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hddc2Q3SXD3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Hddc2Q3SXD3 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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