Protein–RNA interactions for Protein: Q149G0

UPF0561 protein C2orf68 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q149G0 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Q149G0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Q149G0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Q149G0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q149G0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q149G0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q149G0 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q149G0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q149G0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q149G0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q149G0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q149G0 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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