Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc162pQ0VG85 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Ccdc162pQ0VG85 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms