Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm26540-201ENSMUST00000181858 1310 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm12962-202ENSMUST00000144212 691 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sox12Q04890 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Gm5244-202ENSMUST00000189517 743 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sox12Q04890 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms