Protein–RNA interactions for Protein: Q03358

Msx2, Homeobox protein MSX-2, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx2Q03358 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Msx2Q03358 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms