Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gjb4Q02738 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gjb4Q02738 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms