Protein–RNA interactions for Protein: P68372

Tubb4b, Tubulin beta-4B chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4bP68372 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Tubb4bP68372 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Tubb4bP68372 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms