Protein–RNA interactions for Protein: P47934

Crat, Carnitine O-acetyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CratP47934 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
CratP47934 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
CratP47934 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CratP47934 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CratP47934 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CratP47934 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CratP47934 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms