Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
SrprbP47758 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
SrprbP47758 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms