Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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RxrgP28705 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
RxrgP28705 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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