Protein–RNA interactions for Protein: P28230

Gjb1, Gap junction beta-1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb1P28230 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gjb1P28230 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gjb1P28230 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms