Protein–RNA interactions for Protein: P25233

Ndn, Necdin, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NdnP25233 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
NdnP25233 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
NdnP25233 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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