Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

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Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Irf1P15314 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Irf1P15314 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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