Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Apoa4P06728 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Apoa4P06728 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms