Protein–RNA interactions for Protein: P01629

Ig kappa chain V-II region 2S1.3, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01629 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01629 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01629 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01629 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P01629 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P01629 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
P01629 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01629 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01629 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms