Protein–RNA interactions for Protein: O35914

Bnc1, Zinc finger protein basonuclin-1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnc1O35914 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bnc1O35914 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bnc1O35914 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms