Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm21900J3QP38 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm21900J3QP38 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms