Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN9

Gm28038, Predicted gene, 28038 (Fragment), mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28038F7BCN9 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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Gm28038F7BCN9 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Gm28038F7BCN9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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