Protein–RNA interactions for Protein: F7BCN0

Gm28048, Predicted gene, 28048 (Fragment), mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28048F7BCN0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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Gm28048F7BCN0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gm28048F7BCN0 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Gm28048F7BCN0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm28048F7BCN0 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms