Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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Lrp3E9Q1T6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Lrp3E9Q1T6 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrp3E9Q1T6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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Lrp3E9Q1T6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
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