Protein–RNA interactions for Protein: E9PXB6

Sfta2, Surfactant-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfta2E9PXB6 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Ncan-201ENSMUST00000002412 7195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.67
Sfta2E9PXB6 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Sfta2E9PXB6 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms