Protein–RNA interactions for Protein: D3Z622

4930455H04Rik, MCG1045678, mousemouse

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930455H04RikD3Z622 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930455H04RikD3Z622 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms