Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rd3lB2RV38 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms