Protein–RNA interactions for Protein: A6NKD9

CCDC85C, Coiled-coil domain-containing protein 85C, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85CA6NKD9 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC85CA6NKD9 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC85CA6NKD9 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms