Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 AJ239318.1-201ENST00000624445 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CU634019.2-201ENST00000625184 593 ntTSL 3 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MPDZ-212ENST00000538841 3186 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CR382285.2-201ENST00000624662 1495 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 HACD3-209ENST00000566511 1782 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 IQCM-206ENST00000636793 1900 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 KIN-201ENST00000379562 6348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01538-201ENST00000588074 2408 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 FAM26D-201ENST00000368596 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 TET1-201ENST00000373644 9288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RNU6-167P-201ENST00000384292 106 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC007655.1-201ENST00000444324 357 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MYO5BP2-201ENST00000449815 1277 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC104634.1-201ENST00000452720 462 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 NECTIN3-AS1-205ENST00000491709 792 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MSC-AS1-205ENST00000519068 569 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 ASB8-215ENST00000540782 659 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MGAT4C-206ENST00000552435 550 ntTSL 4 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC004596.1-201ENST00000586560 528 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC010487.1-201ENST00000594408 1172 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC095055.1-201ENST00000603472 1113 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 DCLRE1A-201ENST00000361384 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 PHF7-211ENST00000615126 1328 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CASP10-204ENST00000346817 3926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MCM9-209ENST00000619706 4822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01206-204ENST00000482787 9580 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AFF2-201ENST00000286437 12280 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 MTERF1-201ENST00000351870 1997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC079298.1-201ENST00000625026 1619 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 PRKAA1-204ENST00000397128 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AMELX-202ENST00000380712 835 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AMELX-203ENST00000380714 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SNORA5.1-201ENST00000384275 131 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RNU4-34P-201ENST00000410431 124 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC01661-201ENST00000415910 708 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 IL23R-203ENST00000425614 1295 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC005033.1-201ENST00000428904 813 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL158835.2-201ENST00000430970 300 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 LINC00969-211ENST00000438608 525 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC115618.2-201ENST00000453810 450 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC110749.1-201ENST00000462007 357 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 DUBR-205ENST00000495228 411 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC117383.1-201ENST00000507698 422 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC020937.1-201ENST00000519677 1013 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 OR4A46P-201ENST00000527255 933 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CPSF7-220ENST00000541963 549 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC087500.2-201ENST00000575056 498 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC108738.1-201ENST00000603703 237 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 SDR42E1P1-201ENST00000611327 477 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AC007786.3-201ENST00000615154 596 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AGO2-201ENST00000220592 14581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 VPS41-203ENST00000395969 3181 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
GDAP2Q9NXN4 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94 ms