Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC239803.2-201ENST00000610161 430 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 uc_338.26-201ENST00000612659 160 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01676-209ENST00000623043 896 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02033-201ENST00000623207 971 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 COPS7B-225ENST00000631349 189 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC027279.1-201ENST00000568885 4284 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FILIP1L-201ENST00000331335 4219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FHIT-201ENST00000341848 174 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNA5SP375-201ENST00000362975 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPS12P5-201ENST00000423449 371 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL669841.1-201ENST00000425723 558 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPS7P14-201ENST00000426405 583 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC010890.1-202ENST00000432414 535 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SOCS5P1-201ENST00000440415 949 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC113331.2-201ENST00000445557 926 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01072-201ENST00000455848 431 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL049874.2-201ENST00000492636 288 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR10J4-201ENST00000504970 935 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SNX18P24-201ENST00000505249 671 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC021193.1-201ENST00000511607 420 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC025437.2-201ENST00000518103 548 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC051619.2-201ENST00000559063 397 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC104151.1-201ENST00000563764 323 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AF067845.5-201ENST00000633906 437 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL357140.4-201ENST00000636827 412 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 USP15-201ENST00000280377 4748 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC00320-204ENST00000437238 2004 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 C9orf153-204ENST00000613665 1738 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 ANKRD31-203ENST00000506364 6207 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 PPP1R2P3-201ENST00000522232 1991 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OFD1P15Y-201ENST00000411536 1392 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SGIP1-204ENST00000371039 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL445487.1-201ENST00000415694 1580 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LRIT3-202ENST00000594814 3566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CLEC4A-203ENST00000352620 615 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 SPANXN1-201ENST00000370493 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPA3-204ENST00000406109 434 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01638-201ENST00000418271 552 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC022535.1-201ENST00000420082 691 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 LINC02210-201ENST00000444561 288 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SL254P-201ENST00000460609 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCBE1Q6UXH8 RN7SL101P-201ENST00000496350 279 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
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