Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CCNB3-201ENST00000276014 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OPRM1-215ENST00000520708 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TGFBR1-208ENST00000550253 1538 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC091305.2-201ENST00000624049 1576 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PCDH15-207ENST00000395430 7002 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OR13C1P-202ENST00000641378 2919 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CDC23-202ENST00000394886 3155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 GUCY1A3-201ENST00000296518 4400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 YES1P1-201ENST00000418510 1628 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ARHGAP24-201ENST00000264343 4572 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EMSY-206ENST00000525038 4376 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 FAM162A-201ENST00000232125 801 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC01821-201ENST00000419786 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 BX119321.1-201ENST00000428912 797 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC01506-201ENST00000432148 495 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 Z84478.1-201ENST00000438230 1219 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PCBP1-AS1-232ENST00000442040 1111 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL009050.1-201ENST00000445278 426 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL122019.1-202ENST00000458070 546 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC113398.2-201ENST00000507630 558 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ZBED3-AS1-209ENST00000512213 681 ntTSL 3 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC00967-201ENST00000517689 792 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RBM22P12-201ENST00000567098 1255 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC007431.2-201ENST00000577189 563 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MILR1-203ENST00000615220 1196 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP000648.2-201ENST00000624182 404 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 KLRC4-KLRK1-201ENST00000539300 1507 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SSX5-202ENST00000347757 1261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RN7SKP6-201ENST00000364795 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC007389.1-203ENST00000414811 556 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 Z98742.1-201ENST00000419801 632 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 FMR1-IT1-201ENST00000441414 343 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EEF1B2P6-201ENST00000445713 673 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TPT1P1-201ENST00000458495 518 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RPS4XP12-201ENST00000461747 709 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RN7SL814P-201ENST00000487715 300 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC022133.1-201ENST00000490961 571 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC068672.3-203ENST00000505166 311 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC019133.1-201ENST00000508292 420 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02383-201ENST00000508563 582 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP005403.1-201ENST00000579720 229 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC024563.1-201ENST00000601860 618 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC027243.2-201ENST00000602530 724 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL359742.1-201ENST00000622497 540 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DYNAP-201ENST00000321600 2027 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MTCO1P22-201ENST00000604619 1360 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
PDK4Q16654 MGP-201ENST00000228938 694 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
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