Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 DDX58-202ENST00000379883 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MYPN-204ENST00000540630 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CRB1-209ENST00000535699 5140 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TMTC3-201ENST00000266712 7203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC005703.1-201ENST00000431343 1773 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ZNF184-202ENST00000377419 2899 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RBMXL1-201ENST00000321792 4799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR4C11-201ENST00000302231 1045 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 KCNJ13-203ENST00000410029 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AF064860.1-201ENST00000416555 544 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SETP9-201ENST00000423837 832 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TRIM6-205ENST00000445329 2951 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC234781.3-201ENST00000452540 973 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RN7SL354P-201ENST00000469282 294 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 GIMAP2-202ENST00000474605 309 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC025470.2-201ENST00000506106 897 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC113349.1-201ENST00000512105 583 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MFAP5-205ENST00000535336 566 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC091544.7-201ENST00000554000 240 ntTSL 3 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC018558.5-201ENST00000565840 952 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC022916.2-201ENST00000590144 559 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AMZ2-206ENST00000577985 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NOX4-211ENST00000528341 1899 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL021877.2-201ENST00000624442 10684 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 FASTKD2-203ENST00000403094 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PPP4R1L-209ENST00000497138 4680 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TOR1AIP2-201ENST00000367612 7905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 SYT4-201ENST00000255224 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ZSCAN4-201ENST00000318203 2246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL133243.4-201ENST00000623116 3109 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MYBPC1-216ENST00000550270 3426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 ERVFRD-1-201ENST00000472091 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 WDR63-202ENST00000326813 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 INSL4-201ENST00000239316 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC107067.1-201ENST00000500009 1654 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RPL37-201ENST00000274242 7686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PLXNA4-201ENST00000321063 13061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 DNAJC6-203ENST00000395325 5743 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RPL32P3-201ENST00000359025 275 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 RNU6-670P-201ENST00000364312 104 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL354733.1-203ENST00000417672 495 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL929472.2-201ENST00000419993 481 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL451047.1-201ENST00000424451 814 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NPM1P26-201ENST00000426339 738 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 NDUFAF4P2-201ENST00000445374 520 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL596266.1-201ENST00000448132 400 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL451063.1-201ENST00000450164 1133 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC012055.1-201ENST00000511346 1144 ntTSL 3 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC073581.1-201ENST00000519036 575 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 IGKV2D-10-201ENST00000520194 281 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC134349.2-201ENST00000535136 910 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL031320.1-201ENST00000604177 357 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 AL391834.1-201ENST00000609609 560 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 HMGN2-210ENST00000619352 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CAST-202ENST00000325674 3356 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 MYPN-202ENST00000358913 6013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 PTPRZ1-202ENST00000449182 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 IGIP-201ENST00000333305 3458 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
VPS72Q15906 CREM-202ENST00000342105 1541 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.7 ms