Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 UNC80-203ENST00000439458 13562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 IGF1-202ENST00000337514 7359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 STAU2-210ENST00000521210 1950 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ADGRL2-206ENST00000370721 5023 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZNF143-201ENST00000299606 2562 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SPRR2G-201ENST00000368748 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SNORA16A-201ENST00000384342 137 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 IGLV7-43-201ENST00000390298 385 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL133325.1-201ENST00000421090 382 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ERVH-1-201ENST00000507666 639 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC025370.1-201ENST00000523775 583 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP005901.4-201ENST00000577336 569 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC010615.3-201ENST00000597319 394 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL356752.1-201ENST00000615844 593 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC005840.5-201ENST00000619166 599 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC01685-203ENST00000634464 1201 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZNF81-202ENST00000338637 7859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SEC31A-217ENST00000505984 3596 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 BRIP1-202ENST00000577598 3969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 BNIP2-202ENST00000415213 1509 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 NKAIN2-204ENST00000545433 3052 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 SLFN5-201ENST00000299977 10591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 TCP11-207ENST00000418521 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 Z83820.1-201ENST00000456978 1499 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RNA5SP183-201ENST00000362452 119 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL390774.1-201ENST00000411924 246 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 NPM1P4-201ENST00000414095 812 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 OR6C71P-201ENST00000432580 913 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC02038-201ENST00000439074 702 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL137001.1-201ENST00000450212 199 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 MORF4L2P1-201ENST00000503761 858 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC012613.1-201ENST00000522685 387 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP003501.1-201ENST00000524453 744 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 TEX49-202ENST00000548380 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC105402.3-203ENST00000608822 885 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC244107.2-201ENST00000611773 76 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AC073575.2-201ENST00000614212 627 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL359513.1-201ENST00000614364 557 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 OR8S1-202ENST00000641651 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZNF24-202ENST00000399061 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 FAM72A-201ENST00000341209 1774 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 GAPVD1-206ENST00000394104 6737 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
RFTN1Q14699 RGS6-204ENST00000404301 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108 ms