Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC068287.1-201ENST00000430283 295 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC010230.1-202ENST00000506265 592 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC025271.2-201ENST00000566990 800 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL138960.1-201ENST00000613838 513 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SLC30A6-201ENST00000282587 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RABGAP1L-218ENST00000489615 6821 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 POGZ-204ENST00000392723 6152 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL117339.4-201ENST00000608335 7063 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC023632.6-201ENST00000624338 2177 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ACSL5-202ENST00000354655 3351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC00507-201ENST00000540882 1935 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MID1-206ENST00000380787 5973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 BDNF-211ENST00000439476 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NBPF26-202ENST00000611287 2701 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NBPF14-211ENST00000621070 2701 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SLC6A14-202ENST00000598581 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR4N5-201ENST00000333629 927 ntAPPRIS P1 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PPIAP9-201ENST00000403866 498 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL354714.3-201ENST00000447284 493 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 CXorf51A-201ENST00000458472 431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZNF346-IT1-201ENST00000515264 745 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC026719.2-201ENST00000515656 295 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC015912.1-201ENST00000574826 538 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC068112.1-201ENST00000580057 346 ntTSL 3 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC7.25□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NPM1-203ENST00000393820 1598 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ANKRD26P1-204ENST00000571006 4741 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR10G7-202ENST00000641585 3449 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LINC01317-201ENST00000366209 779 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL390036.1-201ENST00000419428 734 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RSL24D1P6-201ENST00000426934 401 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC073062.1-201ENST00000434509 455 ntTSL 5 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR7E125P-201ENST00000443450 846 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AADACP1-204ENST00000483636 1285 ntTSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 GAPDHP56-201ENST00000506031 988 ntBASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC104257.1-202ENST00000524275 884 ntTSL 3 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL049875.1-201ENST00000554328 582 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ZFP42-201ENST00000326866 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 NRG3-202ENST00000372142 3136 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 PLCE1-203ENST00000371385 6500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MAP3K2-201ENST00000344908 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RBM25-201ENST00000261973 6910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC104119.1-201ENST00000508829 339 ntTSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL133166.1-205ENST00000548306 569 ntTSL 4 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 GMFG-202ENST00000594700 397 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL512782.1-201ENST00000603093 364 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC105254.2-201ENST00000603636 436 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC015712.7-201ENST00000615211 635 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LRRC37A3-204ENST00000400877 3273 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AL160286.3-201ENST00000569644 3294 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 FHL5-201ENST00000326771 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 TRPM6-204ENST00000449912 8244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 AC007159.1-201ENST00000566529 4706 ntBASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SLC5A12-201ENST00000280467 2269 ntTSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 ALG11-202ENST00000521508 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 HCG18-237ENST00000444126 4605 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 BX284613.1-201ENST00000452221 1641 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.22□□□□□ -1.25
PTCH1Q13635 EPB41L2-220ENST00000528282 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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