Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC016717.3-201ENST00000624730 554 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL353747.4-202ENST00000625787 674 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC01646-202ENST00000634256 1107 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL513321.2-202ENST00000634479 921 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR10R2-203ENST00000641400 975 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC00102-201ENST00000445785 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DICER1-201ENST00000343455 10277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CHD2-208ENST00000626874 7764 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR5M2P-202ENST00000641241 4242 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MRO-201ENST00000256425 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SLFN12-201ENST00000304905 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC00702-203ENST00000608792 6300 ntTSL 4 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PDZRN4-201ENST00000298919 3411 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF833P-201ENST00000424938 1494 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 GAPVD1-202ENST00000297933 6003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR2L13-203ENST00000641893 1817 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SLC12A1-202ENST00000380993 4707 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC024651.2-201ENST00000562480 2098 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINC01579-207ENST00000557481 3480 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF710-AS1-202ENST00000620791 2133 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DNAH2-201ENST00000389173 13505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ATP10D-203ENST00000504445 2550 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 GOLGB1-202ENST00000393667 11198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PCDH11Y-204ENST00000400457 9039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PTPRT-209ENST00000612229 11285 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MAGI2-235ENST00000637282 3174 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TTR-201ENST00000237014 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RAET1G-201ENST00000367360 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU6-225P-201ENST00000384613 103 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MORN2-202ENST00000409077 465 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 VDAC1P10-201ENST00000416715 891 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL031005.1-201ENST00000416959 723 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CLIC4P3-201ENST00000422221 752 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ELOBP4-201ENST00000423418 296 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SCP2-206ENST00000430330 938 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL050321.1-201ENST00000432363 400 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL590103.1-201ENST00000434488 307 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 VN1R32P-201ENST00000452234 905 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC010878.1-201ENST00000456500 1047 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC110772.1-201ENST00000503037 474 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC106798.1-202ENST00000506819 589 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC083906.1-201ENST00000509298 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 MGC32805-204ENST00000509993 783 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 GYPB-213ENST00000513128 360 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AL117351.2-201ENST00000513571 157 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 C8orf37-AS1-201ENST00000517437 456 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 IGLV3-6-201ENST00000523937 250 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 OR52K3P-201ENST00000531655 943 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC025035.1-201ENST00000551571 894 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 HNRNPCP1-201ENST00000556181 766 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC018767.3-201ENST00000564185 481 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC015574.1-205ENST00000611285 524 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ELMO2P1-201ENST00000611569 473 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 Six3os1_4.1-201ENST00000615706 324 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AP005212.3-201ENST00000619964 528 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 DLST-216ENST00000626051 252 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC073488.7-201ENST00000633785 778 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 JAML-213ENST00000640745 951 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ZNF714-202ENST00000456283 6812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 ROR1-AS1-201ENST00000412349 1574 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 KCNRG-202ENST00000360473 1623 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
FXNQ16595 AC134980.1-209ENST00000639059 2317 ntTSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms