Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CIPC-206ENST00000555611 599 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC012409.1-202ENST00000558449 639 ntTSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC015674.1-201ENST00000578482 267 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC008759.2-201ENST00000585880 600 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL024498.1-201ENST00000606522 1100 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC073488.9-201ENST00000631601 754 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 5_8S_rRNA.6-201ENST00000637374 152 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CCDC121-201ENST00000324364 2342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CWF19L2-201ENST00000282251 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ARHGEF6-203ENST00000370622 4779 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ACE2-202ENST00000427411 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC3.9□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C1orf112-203ENST00000413811 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC092701.1-201ENST00000623627 1551 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LEPR-205ENST00000371060 5135 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FPGT-208ENST00000534056 1426 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL359715.4-201ENST00000606629 1436 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ARHGAP21-202ENST00000376410 3526 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR4F16-201ENST00000332831 995 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DPH5-201ENST00000342173 1143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 SNORA43.1-201ENST00000364863 140 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NQO1-202ENST00000379046 1105 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ATP5E-203ENST00000395663 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 CD200R1L-201ENST00000398214 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SKP281-201ENST00000410472 352 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC110995.1-202ENST00000422914 860 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR4K3-201ENST00000425829 947 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR4F29-201ENST00000426406 995 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AF127936.1-201ENST00000435315 695 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC01832-201ENST00000446520 553 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 OR4F3-201ENST00000456475 995 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL7AP56-201ENST00000476420 791 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MRPS22-205ENST00000478464 1065 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RN7SL282P-201ENST00000479676 297 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPS17P5-201ENST00000498293 408 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PPM1AP1-201ENST00000502740 1135 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TAS2R50-201ENST00000506868 1000 ntAPPRIS P1 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC138866.2-201ENST00000508650 584 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 GUSBP9-201ENST00000510138 584 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC010442.1-201ENST00000515583 816 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 RPL26L1-203ENST00000519239 679 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PCED1B-AS1-210ENST00000552975 378 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC079793.1-201ENST00000553076 713 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AL133240.1-201ENST00000553537 580 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PSMA3-AS1-206ENST00000555037 446 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 TPRX1P1-201ENST00000557620 319 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC013356.3-201ENST00000558601 584 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC092720.1-203ENST00000563921 550 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC025283.1-201ENST00000572039 734 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC009121.2-202ENST00000572706 505 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 ZNF675-204ENST00000599168 592 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC01435-212ENST00000601212 742 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 MALAT1-209ENST00000616691 587 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC005858.3-201ENST00000624756 589 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
VAMP3Q15836 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
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