Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC01378-201ENST00000422145 2516 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 DCAF8L1-201ENST00000441525 3457 ntAPPRIS P1 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TYW3-201ENST00000370867 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PRLR-201ENST00000231423 1679 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AADAT-202ENST00000353187 2101 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TCF7L2-222ENST00000627217 3680 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DLGAP1-AS2-202ENST00000573177 1388 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FCGR3B-208ENST00000613418 2251 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RPL7L1P9-201ENST00000431298 745 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC01767-201ENST00000451914 545 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RN7SL30P-201ENST00000488416 306 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FO393419.2-201ENST00000492975 428 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC015864.1-201ENST00000496512 544 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC018709.1-201ENST00000509111 700 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SNHG27-203ENST00000514222 680 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CREBZF-209ENST00000534224 545 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC023906.4-201ENST00000557898 895 ntTSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL157938.2-208ENST00000590461 877 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC112220.2-201ENST00000605513 533 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC140725.3-201ENST00000616193 880 ntBASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DDX4-202ENST00000354991 2324 ntTSL 5 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CACNA1E-210ENST00000621791 16171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FABP2-201ENST00000274024 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF160-203ENST00000429604 4336 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 OR2T7-201ENST00000641057 3463 ntAPPRIS P1 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 GLYATL1-202ENST00000317391 1627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC02523-201ENST00000423208 2963 ntTSL 1 (best) BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC02388-201ENST00000550678 1975 ntTSL 2 BASIC7.08□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 MRRFP1-201ENST00000435941 1675 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ASNS-209ENST00000444334 1812 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CXorf66-201ENST00000370540 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC024597.1-201ENST00000442753 706 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 CLIC4P1-201ENST00000453177 535 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RPS7P6-201ENST00000485777 579 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC006499.3-201ENST00000506077 748 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 RN7SKP253-201ENST00000516424 309 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC087664.1-201ENST00000521456 358 ntTSL 3 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 IGLVIV-66-1-201ENST00000521832 460 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 OR5D2P-201ENST00000524390 911 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC000068.2-201ENST00000608816 460 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 SERPINB10-204ENST00000619595 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 AC063952.1-204ENST00000635496 927 ntTSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FBXW12-201ENST00000296438 1647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 OR51E2-203ENST00000641638 2626 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 EDA2R-204ENST00000451436 3464 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 UQCC1-208ENST00000397554 3638 ntTSL 2 BASIC7.07□□□□□ -1.28
TCIRG1Q13488 FSCB-201ENST00000340446 2938 ntAPPRIS P1 BASIC7.07□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105 ms