Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CFHR3-201ENST00000367425 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MAP3K20-AS1-203ENST00000423106 2538 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FAM205BP-203ENST00000455647 3752 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MID1-209ENST00000453318 6393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZEB2-241ENST00000637304 9158 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZNF735-201ENST00000429565 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CHD2-215ENST00000628375 3202 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FOXP2-203ENST00000378237 2187 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CREM-217ENST00000439705 2306 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SLC39A12-201ENST00000377369 2808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SH3D19-201ENST00000304527 5273 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR51Q1-201ENST00000300778 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DAPL1-201ENST00000309950 552 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC096571.1-201ENST00000325407 306 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RNU6-157P-201ENST00000383957 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 ATP6V1E1-203ENST00000399798 994 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DAPL1-203ENST00000409042 544 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 SLC3A1-203ENST00000409294 792 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPS26P13-201ENST00000419030 330 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CYP4F30P-202ENST00000420048 405 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PPIAP23-201ENST00000420099 497 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC019211.1-201ENST00000432993 754 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC007422.1-201ENST00000433065 1008 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 YWHAZP7-201ENST00000436906 631 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 GYPE-202ENST00000437468 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL354941.1-201ENST00000438600 464 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 EMC3-AS1-205ENST00000438698 534 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP006216.1-201ENST00000439104 419 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 EIF3LP2-201ENST00000457262 807 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC236972.4-201ENST00000458091 963 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RN7SKP198-201ENST00000459286 306 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPS20P4-201ENST00000461659 355 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC026348.1-201ENST00000462549 1053 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 RPS10P28-201ENST00000480396 498 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC106895.1-202ENST00000502956 777 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL158068.2-201ENST00000510632 563 ntTSL 4 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC097173.2-201ENST00000518701 474 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC060788.1-201ENST00000521318 469 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC013701.1-201ENST00000522657 465 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LONRF1-203ENST00000525024 841 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AP001107.4-201ENST00000533576 539 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR9A4-201ENST00000548136 1093 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC02413-201ENST00000549914 723 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC091304.4-201ENST00000565703 620 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC091932.1-201ENST00000569381 427 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MMP2-AS1-203ENST00000620495 625 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC114546.4-201ENST00000624413 369 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR51Q1-202ENST00000641085 1096 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AL137058.3-201ENST00000624531 3099 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 EOGT-208ENST00000540764 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 PCYT1A-204ENST00000419333 1325 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 CBLB-205ENST00000407712 1493 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MYBL1-206ENST00000524176 2148 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 OR2J1-202ENST00000641659 2144 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 LINC01422-201ENST00000434868 6043 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 AC017007.4-201ENST00000503353 1352 ntBASIC5.96□□□□□ -1.45
TOP3AQ13472 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
TOP3AQ13472 ARHGAP20-206ENST00000533353 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.8 ms