Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC022106.1-201ENST00000612834 766 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 U1.25-201ENST00000614085 162 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 U1.31-201ENST00000620022 160 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC099654.15-201ENST00000639802 509 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ARHGAP29-201ENST00000260526 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CALN1-203ENST00000395276 9189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 C4orf36-203ENST00000473559 2306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC104024.1-201ENST00000428142 2201 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TESPA1-212ENST00000532804 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 OFD1P6Y-201ENST00000432335 1637 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TTTY9B-201ENST00000433794 1637 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 IL21-AS1-201ENST00000417927 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CHD8-202ENST00000430710 7420 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC079753.1-201ENST00000623243 3868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RUFY3-202ENST00000381006 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CABYR-207ENST00000486759 1664 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINGO2-204ENST00000613945 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CASC11-201ENST00000502463 3301 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC093671.1-201ENST00000624981 2929 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 BX322639.1-201ENST00000609841 6590 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 TOR1AIP2-206ENST00000609928 4364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 OR10A2-201ENST00000307322 1053 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RN7SKP250-201ENST00000363924 321 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RNA5-8SP5-201ENST00000365304 152 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RBMS3-AS2-201ENST00000366321 582 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 FIG4-202ENST00000368941 791 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 G6PC2-202ENST00000375363 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RN7SKP278-201ENST00000410504 342 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RN7SKP166-201ENST00000410812 305 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC000058.1-201ENST00000415249 536 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 MS4A6A-202ENST00000420732 863 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC006065.1-201ENST00000422539 802 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NAP1L4P2-201ENST00000425958 899 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 USP9YP11-201ENST00000427537 717 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 UBE2V1P1-201ENST00000430836 445 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RPSAP32-201ENST00000432681 526 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AF127577.2-201ENST00000436429 824 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL583839.2-201ENST00000443716 641 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC079612.2-201ENST00000446029 348 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC104411.1-201ENST00000480817 320 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RPL12P30-201ENST00000488389 499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC108866.1-203ENST00000504106 529 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC008945.1-201ENST00000505144 499 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CETN3-206ENST00000522864 738 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC130365.2-201ENST00000525882 1201 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 KCTD21-AS1-203ENST00000527321 586 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 GPATCH2L-203ENST00000553588 776 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 SRP14-AS1-203ENST00000560341 669 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC022523.1-201ENST00000560360 364 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC087190.2-201ENST00000565648 731 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC02193-202ENST00000566864 719 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC008109.1-201ENST00000583163 826 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL135999.3-201ENST00000610501 812 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL080312.2-201ENST00000613001 630 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 RN7SL261P-201ENST00000613441 282 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AL390318.1-201ENST00000624564 687 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 LINC01450-201ENST00000443406 3263 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 GTDC1-204ENST00000392869 10514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 AC016583.1-201ENST00000624221 2431 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CYP3A43-201ENST00000222382 1515 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
SP140Q13342 CERS3-203ENST00000538112 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.2 ms