Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CCR5-201ENST00000292303 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 NELL2-205ENST00000452445 3196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC005224.3-201ENST00000584683 2140 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GHR-211ENST00000618088 4491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 FOXP2-202ENST00000360232 1412 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 FCER1G-201ENST00000289902 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RN7SKP28-201ENST00000364770 305 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 HNRNPA1P29-201ENST00000426409 879 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL583785.1-201ENST00000428006 512 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 BX276092.6-201ENST00000430476 250 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL162385.2-201ENST00000437864 285 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SNRPFP2-201ENST00000440710 251 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 VDAC2P4-201ENST00000452925 711 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 BX276092.8-201ENST00000455722 250 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC026782.2-201ENST00000510845 636 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 TOMM22P4-201ENST00000511318 336 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ATG10-208ENST00000513634 618 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR8Q1P-201ENST00000526467 655 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC079414.1-201ENST00000563114 488 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MIR762HG-201ENST00000564901 648 ntTSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PPATP2-201ENST00000605635 508 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL022394.1-201ENST00000606979 292 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL021707.7-201ENST00000607991 416 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC132068.1-201ENST00000623805 459 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC01708-202ENST00000634316 859 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PCGF5-201ENST00000336126 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.88□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RGPD2-203ENST00000638730 5306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 DCDC1-207ENST00000452803 1706 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 SAMD9L-204ENST00000437805 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR1F12-201ENST00000402365 945 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 DPPA2P3-201ENST00000411853 655 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MTATP6P11-201ENST00000428071 670 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL122019.1-201ENST00000438575 798 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GCSAM-204ENST00000484193 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC090638.1-201ENST00000498296 909 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC010451.1-201ENST00000509057 556 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC116424.1-203ENST00000513940 671 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 RNU6-491P-201ENST00000516099 110 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 OR10D4P-201ENST00000525892 951 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 GTF2H1-208ENST00000526630 932 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC068025.2-201ENST00000584958 419 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 LINC01835-202ENST00000589345 450 ntTSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 UBA52-209ENST00000597451 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 HMGB1P51-201ENST00000605166 638 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL592494.3-201ENST00000609485 464 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AL163952.1-201ENST00000612704 916 ntTSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CFTRP2-201ENST00000634304 199 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 AC002429.2-202ENST00000637269 394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ZNF92-203ENST00000431504 2947 ntTSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 MTTP-203ENST00000457717 4092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 UGT2A2-202ENST00000604629 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.87□□□□□ -1.31
CHAF1AQ13111 CCT6B-203ENST00000436961 1639 ntTSL 2 BASIC6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms