Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RPL7P51-201ENST00000490532 749 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 IGBP1P4-201ENST00000503202 879 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC108157.1-201ENST00000510511 539 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC109464.1-201ENST00000511091 819 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MTND6P2-201ENST00000512226 524 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ARL6IP1P3-201ENST00000524544 560 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC073569.1-201ENST00000548469 667 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC068643.1-201ENST00000548594 755 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ULK4P1-201ENST00000564495 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ULK4P2-204ENST00000569682 798 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC022031.2-203ENST00000587346 565 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC239809.3-206ENST00000596091 741 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CDC42EP3P1-201ENST00000601004 764 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL162574.1-201ENST00000615702 950 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RLIMP2-201ENST00000427891 1563 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 DNHD1-201ENST00000254579 14862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC239868.2-201ENST00000564237 4527 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 LINC01520-201ENST00000441457 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ZNF850-202ENST00000591344 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PGBD4-201ENST00000397766 6612 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 SNORD56.6-201ENST00000384569 71 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PEX12P1-201ENST00000400284 1048 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 OXSM-202ENST00000420173 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 CHEK2P5-201ENST00000423877 246 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 AC093607.1-202ENST00000499715 559 ntTSL 4 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 LINC00663-202ENST00000586816 306 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 XIAP-205ENST00000434753 8415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
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HOXD13P35453 EIF3E-206ENST00000519030 1324 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC004158.1-201ENST00000564508 4319 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 BMPR1B-202ENST00000394931 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 PI15-202ENST00000523773 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 HIST1H1A-201ENST00000244573 648 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 ITGB3BP-201ENST00000271002 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 AC092681.1-201ENST00000297369 291 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 IFNA10-201ENST00000357374 963 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
HOXD13P35453 RNA5SP335-201ENST00000363817 110 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
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