Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC005154.1-228ENST00000454922 1405 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 INTU-201ENST00000335251 13233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L2-226ENST00000530757 4360 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 RN7SKP1-201ENST00000365525 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 HIBCH-207ENST00000410045 854 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 RPS7P8-201ENST00000418311 581 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC01031-201ENST00000420807 779 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 ATP5LP4-201ENST00000434169 307 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 C5orf24-203ENST00000435259 851 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 L29074.1-201ENST00000456072 534 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC006296.2-201ENST00000507932 764 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 CHCHD7-205ENST00000517933 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC099520.1-208ENST00000518276 472 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-AS1-209ENST00000520585 818 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 OR8G3P-201ENST00000533406 921 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC023080.1-201ENST00000551663 931 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC127522.1-201ENST00000560531 751 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC100821.2-201ENST00000565668 440 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC091132.5-202ENST00000587078 501 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC008280.3-201ENST00000606436 732 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC135068.5-201ENST00000624197 983 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 Z83818.2-201ENST00000635331 433 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
HMGB1P1B2RPK0 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LYPD6B-202ENST00000409029 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02010-202ENST00000471638 1829 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ZFHX4-207ENST00000521891 14019 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01990-201ENST00000609293 1487 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 ROS1-201ENST00000368507 7417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NBPF10-202ENST00000617010 11630 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 HERC4-205ENST00000412272 4211 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SMR3B-201ENST00000304915 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL353751.1-201ENST00000354541 495 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 WFDC11-202ENST00000356562 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 SPP1-202ENST00000360804 1196 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 PAGE2-201ENST00000374965 456 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC235097.1-201ENST00000412163 681 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AKR1D1-203ENST00000432161 1236 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 GTF3AP6-201ENST00000432585 986 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 NPM1P33-201ENST00000438918 872 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC01681-201ENST00000439184 760 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MEMO1P4-201ENST00000453590 386 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 OR7E22P-201ENST00000478335 1035 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 COX6B1P2-201ENST00000489624 230 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC107391.1-201ENST00000514966 412 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 COX6C-205ENST00000520468 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AP001893.1-201ENST00000532866 362 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC137627.1-201ENST00000545761 289 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 AC026898.1-201ENST00000586404 571 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 MIR7515HG-250ENST00000592565 856 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
HMGB1P1B2RPK0 CT45A1-202ENST00000594565 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.6 ms