Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL512310.9-201ENST00000553311 948 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC093525.4-201ENST00000562232 459 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC009167.1-201ENST00000568317 579 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC136443.4-201ENST00000568759 579 ntTSL 4 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC087392.1-201ENST00000576252 820 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MIR4701-201ENST00000583094 63 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC008894.1-201ENST00000587693 367 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 UBA2-208ENST00000592791 910 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01999-201ENST00000592917 646 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 uc_338.31-201ENST00000615595 186 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CKLF-CMTM1-206ENST00000616804 678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC069234.4-201ENST00000621276 412 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DLC1-209ENST00000511869 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NBPF19-201ENST00000369227 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NBPF20-203ENST00000594479 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 NBPF14-210ENST00000621066 3670 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 GNG2-212ENST00000556752 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RBM48-202ENST00000481551 4093 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ITGB1-201ENST00000302278 3640 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 IKZF3-213ENST00000439167 1879 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PARP8-212ENST00000505697 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC022325.1-201ENST00000502748 2199 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF300P1-202ENST00000520773 3115 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DTNA-230ENST00000598334 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DCN-204ENST00000425043 1438 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MMAA-205ENST00000541599 1437 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TCF4-290ENST00000638154 7801 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 G3BP1-202ENST00000394123 10240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ADAM20-201ENST00000256389 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 TRIM22-201ENST00000379965 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 C15orf54-202ENST00000625107 3078 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SEPT7-203ENST00000399035 4066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 OR5P2-201ENST00000329434 1069 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SNORA21-201ENST00000362423 132 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 S100A5-201ENST00000368717 506 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SNORA77.2-201ENST00000408571 112 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MYL6P5-201ENST00000412707 459 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL035422.1-201ENST00000414193 397 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 RPL12P12-201ENST00000424633 501 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC115285.1-201ENST00000424879 736 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 DPYD-IT1-201ENST00000424982 401 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC244394.2-201ENST00000425109 735 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL162727.2-201ENST00000428429 395 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AL157884.3-201ENST00000448273 1184 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 SYPL1-205ENST00000470347 1193 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PFN2-209ENST00000481275 560 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP002453.1-201ENST00000492327 668 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 CCDC11P1-201ENST00000503137 1162 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC02513-201ENST00000503465 500 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 HPRT1P1-201ENST00000509498 657 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PLAC8-205ENST00000509973 489 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 LINC01932-201ENST00000520323 573 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 BUD31P1-201ENST00000521828 359 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC099520.1-205ENST00000524083 316 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC137800.1-201ENST00000562976 573 ntTSL 4 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 MRPS21P8-201ENST00000569196 235 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC106037.2-201ENST00000578583 447 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 ZNF486-202ENST00000597083 734 ntTSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC146944.4-201ENST00000602697 718 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
EHD3Q9NZN3 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 417.7 ms