Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RUFY3-201ENST00000226328 4233 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC092159.1-201ENST00000433724 493 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL443P-201ENST00000464331 290 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC083809.1-201ENST00000615051 472 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 FRYL-209ENST00000506685 1940 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 TXNDC8-201ENST00000374507 1787 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 OR52E5-201ENST00000610445 2244 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SNORA70.6-201ENST00000383934 134 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 GLULP6-201ENST00000399502 913 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 OR2A25-201ENST00000408898 1014 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CYCSP42-201ENST00000450823 238 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 BX842559.2-201ENST00000451418 605 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC011487.3-201ENST00000593607 453 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC097467.3-209ENST00000595760 615 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 IL16-204ENST00000394660 9616 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ADH6-202ENST00000394897 3337 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NRG1-220ENST00000539990 2401 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ATF2-201ENST00000264110 4176 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZNF230-201ENST00000429154 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 DNAH10-210ENST00000638045 13678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 UGT2B11-201ENST00000446444 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 BRCA1-210ENST00000471181 5936 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC087258.1-203ENST00000545400 1629 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC017019.1-201ENST00000426129 261 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL359265.2-201ENST00000434367 631 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC012629.1-201ENST00000503953 342 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC079414.3-201ENST00000612986 1090 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC019206.1-201ENST00000621938 425 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 MDM4-207ENST00000454264 9926 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 MCM8-205ENST00000610722 7486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SNRPB2-202ENST00000377943 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 STARD4-AS1-201ENST00000500779 5525 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NPHP1-204ENST00000417665 2246 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 FBXW2-205ENST00000608872 9138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 PLCXD3-202ENST00000377801 7704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC010531.4-202ENST00000569872 1718 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V1A-201ENST00000273398 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 INTS6-202ENST00000398119 7041 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 KIF1B-203ENST00000377083 5885 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CCNYL2-202ENST00000637719 3311 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 FER1L6-201ENST00000522917 6051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ZNF286A-202ENST00000395894 5443 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLMAP-206ENST00000428312 4132 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 LINC01847-202ENST00000523311 1762 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NLRP11-202ENST00000589824 3231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL035079.1-201ENST00000405210 287 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 Z73495.1-201ENST00000444982 147 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 OR2A3P-201ENST00000493774 953 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC136777.2-201ENST00000522979 358 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC027369.5-201ENST00000533838 755 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 FAM174B-202ENST00000553393 495 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 WISP3-211ENST00000639360 1026 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AC004076.2-201ENST00000620532 3323 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SLC7A6-209ENST00000566454 6308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 CIITA-201ENST00000324288 11952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 ITGAV-204ENST00000433736 3288 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 INSIG2-208ENST00000614681 1347 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 AL450345.1-202ENST00000605741 3881 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 SOX6-201ENST00000316399 8808 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 PSMA8-205ENST00000612461 1619 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 NAV3-202ENST00000536525 7386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 VANGL1-202ENST00000355485 8691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 TCF4-278ENST00000636400 8343 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 GPR155-206ENST00000614352 7321 ntTSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
LRRIQ1Q96JM4 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 179 ms