Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 RGS6-206ENST00000407322 1497 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MEG8-223ENST00000638012 3757 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PINCR-201ENST00000440955 2228 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NPY6R-202ENST00000510937 2988 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SLC1A3-216ENST00000613445 4030 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OR9G4-201ENST00000302957 984 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC017079.1-201ENST00000333650 415 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SSX3-202ENST00000376893 800 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LYPLA1P3-201ENST00000402650 695 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SLC20A1P1-201ENST00000413906 956 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC104333.2-201ENST00000422630 192 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC01589-201ENST00000422971 548 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC124944.2-201ENST00000429866 1242 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL354896.1-201ENST00000430214 561 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CYP3A5-203ENST00000439761 1075 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC005297.1-201ENST00000444765 862 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC073909.1-201ENST00000447112 999 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NPM1P19-201ENST00000450070 712 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LRRC77P-202ENST00000463642 457 ntTSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NDUFA5P5-201ENST00000468361 342 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL163195.3-202ENST00000555283 578 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC00687-203ENST00000558175 696 ntTSL 3 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PSMA4-209ENST00000559082 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AP002884.5-201ENST00000595053 1132 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TMSB15B-207ENST00000598087 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 Z98949.1-207ENST00000609157 814 ntTSL 5 BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RBM41-201ENST00000372479 1662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CTAGE5-207ENST00000396165 3071 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC133552.1-201ENST00000569988 4007 ntBASIC5.39□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PATE1-201ENST00000305738 1527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CNTN5-201ENST00000279463 5925 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AIG1-208ENST00000494282 3393 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC005005.4-201ENST00000623789 16698 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC021205.3-201ENST00000609680 1709 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NUP37-201ENST00000251074 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 DEFB118-201ENST00000253381 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RNU1-19P-201ENST00000363306 165 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 RPL10P10-201ENST00000403509 664 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 EEF1B2P8-201ENST00000414101 671 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC096644.3-201ENST00000416788 338 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL450384.1-201ENST00000433526 413 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC046176.1-201ENST00000435260 1170 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 BTG3P1-201ENST00000435859 716 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL139161.2-201ENST00000438371 740 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CD200R1L-202ENST00000448932 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LRRC37A14P-201ENST00000452297 462 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC094085.1-201ENST00000468914 584 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02271-202ENST00000506379 596 ntTSL 4 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC110288.1-201ENST00000517950 446 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC012555.2-201ENST00000549448 413 ntTSL 3 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02402-201ENST00000550337 1212 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC005726.4-201ENST00000582858 458 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 Z98949.1-220ENST00000609809 804 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 MIR193BHG-214ENST00000641765 509 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02047-201ENST00000494761 1371 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CDC5L-201ENST00000371477 6423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 A1CF-205ENST00000374001 9221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 SPINK5-202ENST00000359874 3656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 ARPP19-208ENST00000566423 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 LINC02227-201ENST00000619068 3748 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 NLRC4-203ENST00000402280 3355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
PDK4Q16654 FAM19A1-201ENST00000478136 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.8 ms