Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 OR5D13-201ENST00000623930 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF19-206ENST00000565100 2087 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CHRM3-AS2-201ENST00000427859 2431 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TM9SF4-202ENST00000398022 3978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PMFBP1-207ENST00000537465 3935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PDE1C-203ENST00000396184 8852 ntTSL 1 (best) BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC022164.1-201ENST00000568767 2673 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL590763.1-201ENST00000398297 1545 ntBASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.11□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 FYB2-201ENST00000343433 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 C2orf16-201ENST00000408964 6200 ntAPPRIS P2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LGI1-219ENST00000636155 1618 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL353692.2-201ENST00000407054 335 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 NT5C3A-206ENST00000409787 840 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RNU6-584P-201ENST00000410350 95 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC092447.3-201ENST00000426027 686 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC009948.1-206ENST00000436616 1020 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC034195.1-203ENST00000455703 728 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC112495.1-201ENST00000456037 756 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 FTH1P8-201ENST00000498161 514 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC008147.3-201ENST00000548666 354 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL121839.1-201ENST00000556233 1185 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC018557.2-201ENST00000565082 536 ntTSL 5 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC027216.1-201ENST00000577726 685 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PRELID3BP3-201ENST00000584963 545 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SLC14A2-AS1-201ENST00000585759 494 ntTSL 3 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC068057.2-201ENST00000624047 895 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 UTP15-208ENST00000543251 4922 ntTSL 2 BASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC7.1□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ESRRG-205ENST00000366937 5365 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 HSPD1P8-201ENST00000400121 1658 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SAMM50P1-201ENST00000455403 1399 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL161912.4-201ENST00000623889 2468 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 UGGT1-201ENST00000259253 10650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MRC1-201ENST00000569591 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ALG2-202ENST00000319033 1627 ntTSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TSPAN14-207ENST00000429989 16183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PWAR1-201ENST00000624188 2414 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC109780.1-201ENST00000451768 1344 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF345-215ENST00000614069 3103 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MTHFD2P5-201ENST00000320415 844 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AF228730.1-201ENST00000397972 663 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 VN1R21P-201ENST00000426703 765 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RPS3AP38-201ENST00000435889 763 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AF015262.1-201ENST00000455028 698 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RPL7P45-201ENST00000455851 743 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RN7SL51P-201ENST00000468230 285 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 EPPIN-WFDC6-201ENST00000504988 1156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 PGAM1P13-201ENST00000507497 754 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MEF2C-AS1-208ENST00000512585 741 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 OR10G5P-201ENST00000532733 358 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 RUVBL2-214ENST00000640699 153 ntTSL 5 BASIC7.09□□□□□ -1.27
TCIRG1Q13488 SAMMSON-227ENST00000642114 1199 ntBASIC7.09□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.8 ms