Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 GTF2H1-210ENST00000530496 1700 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 STXBP5-201ENST00000321680 3456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NTRK3-212ENST00000558676 4670 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZMYND8-221ENST00000619049 4027 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OPALIN-206ENST00000611913 3115 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MXI1-203ENST00000361248 2188 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01105-203ENST00000431188 3329 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PAH-201ENST00000307000 2466 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 SRSF11-202ENST00000370950 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 OR4M1-201ENST00000315957 1116 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 TRAV27-201ENST00000390457 425 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC099535.1-201ENST00000408928 371 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL603650.1-201ENST00000412680 240 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC019130.1-201ENST00000413841 391 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPLP1P10-201ENST00000413972 339 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC106900.1-201ENST00000418620 456 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LINC01522-201ENST00000428999 429 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL355483.4-201ENST00000432653 470 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL590682.1-201ENST00000437248 344 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MAP3K13-207ENST00000438798 388 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 LIN28AP2-201ENST00000445283 458 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 PPIAP32-201ENST00000449940 472 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RN7SL741P-201ENST00000482473 289 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC011396.3-201ENST00000508845 512 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP003354.2-201ENST00000517983 563 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC015468.2-201ENST00000519605 550 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 NDUFA3P2-201ENST00000531434 232 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC099518.1-201ENST00000568032 841 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC012146.1-204ENST00000570712 426 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AP001122.1-201ENST00000572256 541 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ZNF174-204ENST00000572544 1002 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC138207.8-206ENST00000580053 637 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 ARF4-AS1-203ENST00000607782 552 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC008115.3-201ENST00000614874 549 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC244100.1-201ENST00000618141 407 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC009268.2-201ENST00000621925 457 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC005618.4-201ENST00000625053 554 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 AC011346.1-204ENST00000638089 1210 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CEP290-207ENST00000552810 7948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 USP3-201ENST00000268049 5311 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DDX24-201ENST00000330836 2738 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RIPOR2-208ENST00000613507 5539 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 RBFOX2-205ENST00000405409 6932 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 CACYBP-209ENST00000613570 2835 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
CLN3Q13286 DNAJC6-201ENST00000263441 5916 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PLD5-203ENST00000427495 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SLC31A1-201ENST00000374212 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RIF1-205ENST00000444746 7897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GPC3-204ENST00000631057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 SLC4A10-204ENST00000421911 3398 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL353795.1-201ENST00000439134 1775 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ITPR1-203ENST00000357086 9762 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ZHX3-211ENST00000544979 3933 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL954650.1-201ENST00000430776 2051 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 NRXN3-203ENST00000428277 4219 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 C7-201ENST00000313164 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 VAMP3-201ENST00000054666 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 AL133320.1-201ENST00000621423 2352 ntBASIC7.15□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR4Q2-201ENST00000541415 2778 ntAPPRIS P5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LRBA-204ENST00000507224 8826 ntTSL 5 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LINC00954-202ENST00000449086 2995 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PTER-203ENST00000423462 3212 ntTSL 3 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RRM2-213ENST00000641198 3431 ntAPPRIS P1 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 TNPO3-204ENST00000482320 3585 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 PHF6-202ENST00000370799 4186 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 ORM1-201ENST00000259396 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 EPYC-201ENST00000261172 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 KAT6A-201ENST00000265713 9153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 OR2M1P-201ENST00000318104 951 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 HEPH-201ENST00000336279 4228 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC7.14□□□□□ -1.27
CLN3Q13286 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC7.14□□□□□ -1.27
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