Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 AC009784.1-201ENST00000426484 460 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL136140.1-201ENST00000436113 473 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 GAPDHP25-201ENST00000447061 1001 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPS26P41-201ENST00000450370 284 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OR2AF1P-201ENST00000454899 889 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RSRC1-207ENST00000475278 1195 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 EIF4E-204ENST00000504432 1132 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC126177.5-201ENST00000549599 178 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC010547.7-201ENST00000570323 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC105094.2-202ENST00000590968 566 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC010531.5-201ENST00000602779 450 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 SAMD9L-209ENST00000610760 1221 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 MUC12-206ENST00000536621 16321 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 PWRN2-202ENST00000567246 4295 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 CHEK1-216ENST00000534070 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
NME3Q13232 ALB-202ENST00000401494 1659 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NME3Q13232 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CRYZ-204ENST00000370872 1592 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC011287.1-206ENST00000638774 2642 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 KLHL5-202ENST00000261426 3300 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL929601.4-201ENST00000613011 1341 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC01553-203ENST00000521074 4329 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CYP3A7-CYP3A51P-202ENST00000620220 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 WFDC11-201ENST00000324384 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PLIN2-202ENST00000380464 655 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR105-1-201ENST00000385222 81 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC109779.1-201ENST00000414475 573 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 LINC01690-201ENST00000424837 576 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TAAR4P-201ENST00000454843 1039 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC092590.1-201ENST00000471672 737 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC058823.1-201ENST00000485315 474 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC011411.1-201ENST00000509592 876 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNU6-941P-201ENST00000516346 108 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MTND2P17-201ENST00000550281 688 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 C16orf52-205ENST00000567004 951 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ZNF561-AS1-207ENST00000591932 676 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC109309.2-201ENST00000612597 332 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CU638689.1-201ENST00000623225 897 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 CU634019.4-201ENST00000623347 897 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 MYOCOS-202ENST00000636788 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 UBXN7-201ENST00000296328 10568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC112198.2-201ENST00000426589 6996 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 PROX1-205ENST00000498508 8498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR2AT4-203ENST00000641541 8795 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 STON1-201ENST00000404752 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNF32-203ENST00000392741 2260 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AC090518.1-201ENST00000562300 1495 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
NME3Q13232 TRAPPC13-201ENST00000231526 2715 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 SMNDC1-202ENST00000369603 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 AP001029.2-203ENST00000589795 4910 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNU1-149P-201ENST00000390870 161 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 NACAP7-201ENST00000407371 609 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
NME3Q13232 RNA5SP487-201ENST00000410186 122 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms